Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xbp1O35426 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xbp1O35426 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms