Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms