Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc1O35379 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc1O35379 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 369.7 ms