Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih1O35372 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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