Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms