Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Kcns1O35173 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Kcns1O35173 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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