Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Polr1aO35134 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms