Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LhbO09108 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LhbO09108 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LhbO09108 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LhbO09108 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LhbO09108 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LhbO09108 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LhbO09108 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LhbO09108 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LhbO09108 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms