Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumblO08919 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumblO08919 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumblO08919 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumblO08919 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumblO08919 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumblO08919 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms