Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MttpO08601 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MttpO08601 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MttpO08601 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MttpO08601 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MttpO08601 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MttpO08601 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MttpO08601 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MttpO08601 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MttpO08601 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MttpO08601 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MttpO08601 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MttpO08601 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MttpO08601 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MttpO08601 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MttpO08601 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MttpO08601 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MttpO08601 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MttpO08601 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MttpO08601 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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