Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms