Protein–RNA interactions for Protein: O08524

Tectb, Beta-tectorin, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TectbO08524 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TectbO08524 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TectbO08524 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TectbO08524 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TectbO08524 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TectbO08524 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TectbO08524 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TectbO08524 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TectbO08524 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TectbO08524 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TectbO08524 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TectbO08524 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TectbO08524 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms