Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl4M0QW46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms