Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Speer4dL7N216 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4dL7N216 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4dL7N216 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4dL7N216 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms