Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms