Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
1700014D04RikJ3QMS2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms