Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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