Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms