Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Taf4bG5E8Z2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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