Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms