Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3tc1G3X9F6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms