Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna9G3X8Z7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms