Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-1G3UXB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms