Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms