Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms