Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScaperF8VQ70 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms