Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms