Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
D430041D05RikF6ZGR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms