Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd7E9Q9W7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms