Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lbE9Q9U0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lbE9Q9U0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms