Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga10E9Q6R1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms