Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Simc1E9Q6E9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms