Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf11E9Q6E5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf11E9Q6E5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms