Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20518E9Q548 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms