Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc71lE9Q4T4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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