Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd1E9Q3H4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms