Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp1E9Q368 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms