Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsperg1E9Q355 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Catsperg1E9Q355 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms