Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr17E9Q271 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr17E9Q271 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms