Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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