Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5cE9Q1F5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5cE9Q1F5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo5cE9Q1F5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms