Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms