Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scaf11E9PZM7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf11E9PZM7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms