Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd1E9PZ26 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd1E9PZ26 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms