Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp54bE9PXC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms