Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn4E9PX29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms