Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Abca16E9PWJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abca16E9PWJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms