Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim5E9PV98 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms