Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FgaE9PV24 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms