Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Piezo1E2JF22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms